Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC78A2IDD5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms