Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms