Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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