Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9Y3F1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9Y3F1 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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