Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP20Q9Y2K6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP20Q9Y2K6 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms