Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC7AQ9ULT0 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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