Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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