Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
XCL2Q9UBD3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms