Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00474Q9P2X8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms