Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARHGAP28Q9P2N2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms