Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
HIGD1BQ9P298 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms