Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CNTN3Q9P232 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTN3Q9P232 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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