Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CALCOCO1Q9P1Z2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms