Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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SH3BP4Q9P0V3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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