Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PNPLA8Q9NP80 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms