Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSER1Q9C0I3 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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