Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CEP44Q9C0F1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms