Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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CIPCQ9C0C6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CIPCQ9C0C6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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CIPCQ9C0C6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CIPCQ9C0C6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CIPCQ9C0C6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CIPCQ9C0C6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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CIPCQ9C0C6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CIPCQ9C0C6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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