Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SMIM3Q9BZL3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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