Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
RETNLBQ9BQ08 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms