Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP88Q99567 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP88Q99567 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms