Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX27Q96L92 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms