Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA3Q96KX2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms