Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF397Q8NF99 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms