Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RYBPQ8N488 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms