Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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