Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PHYHD1Q5SRE7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms