Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SEC14L1-203ENST00000431431 2504 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HIST1H3G-201ENST00000614378 2411 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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