Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LETM2Q2VYF4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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