Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CDKN3Q16667 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDKN3Q16667 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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