Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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TRIP13Q15645 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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