Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms