Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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COL4A6Q14031 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COL4A6Q14031 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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