Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms