Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
DDX39BQ13838 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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