Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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BNIP1Q12981 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BNIP1Q12981 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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