Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms