Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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