Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FMODQ06828 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FMODQ06828 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms