Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPN11Q06124 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms