Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FPGSQ05932 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms