Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms