Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NHLH2Q02577 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms