Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APBA1Q02410 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms