Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
E2F1Q01094 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms