Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK16Q00536 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDK16Q00536 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDK16Q00536 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms