Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXC5Q00444 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms