Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKOR1P84550 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKOR1P84550 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms