Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IRX4P78413 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IRX4P78413 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IRX4P78413 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms