Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms